南京农业大学和江南大学在院校历史、专业设置等各有优势，无法直接评判优劣。

如果您倾向于农业科学和研究，希望在一个拥有悠久历史和丰富研究资源的环境中学习，可以选择南京农业大学的农业科学或者生物科学专业。

如果您更倾向于食品科技或轻工业方面的学习，希望在一个有强大实践和实验资源的环境中发展，可以选择江南大学的食品科学与工程或者轻工技术与工程专业。