复旦专硕的缺点主要包括以下几个方面：

学费较贵 ：专硕的学费通常较高，没有像学硕那样的学费限制，有的项目甚至可以达到十几万元。

就业竞争激烈 ：由于专硕毕业生数量较多，且很多专业硕士项目注重实践应用，导致在就业市场上面临较大的竞争压力。

学术深度不足 ：专硕课程通常更侧重于实践技能的培养，可能在学术研究和理论知识方面不如学术型硕士（学硕）深入。

学术导向有限 ：相对于学硕，专硕在学术研究方面的导向较为有限，对于希望继续从事学术研究的学生可能不够满足。

课程和实习实践不足 ：部分专硕项目在课程建设和实习实践方面可能存在不足，影响学生实践能力的培养。

社会认可度问题 ：尽管专硕和学硕都是硕士学位，但在某些行业和领域，社会对专硕的认可度可能不如学硕。

个人兴趣与专业匹配度问题 ：部分学生在选择专硕时可能没有充分考虑自己的兴趣和未来发展方向，导致毕业后面临专业与职业兴趣不匹配的问题。

工作稳定性和职业发展前景 ：专硕毕业生更多进入企业工作，可能面临工作不稳定和职业发展压力，尽管企业可能提供更多的晋升机会。

这些缺点可能会对不同学生的职业规划和发展产生不同的影响，因此选择专硕时，学生需要根据自己的兴趣、职业目标和经济情况做出综合考虑。