南京航空航天大学的研究生主要分布在 明故宫校区和将军路校区 。具体分布如下：

明故宫校区 ：

航空学院、能源与动力学院、机电学院、中英学院等学院的硕士和博士研究生。

将军路校区 ：

自动化学院、电子信息工程学院、材料科学与技术学院、民航学院、理学院、经济与管理学院、人文与社会科学学院、艺术学院、外国语学院、航天学院、计算机科学与技术学院、马克思主义学院等学院的硕士和博士研究生。

此外，有信息称从第六个院系的研究生开始，多数在江宁校区，包括民航学院（七院）的本科和研究生。

建议直接咨询学校相关部门或访问官方网站获取最新信息，因为校区分布可能会有变化。