在南京，单行道违规的处罚标准如下：

扣3分，罚款200元 ：

根据最新的法规，对于单行线逆行的行为，一般扣3分，罚款200元。

特殊情况下的罚款 ：

如果驾驶人在单行道上逆行，除了上述的扣3分，罚款200元外，还可能面临其他处罚，例如驾驶证被吊销等。

未拍到或未发现的处罚 ：

如果单行道违规未被电子监控设备拍到或交警现场发现，则可能不会受到处罚。

综上所述，南京单行道违规的处罚主要是扣3分，罚款200元。建议司机朋友们严格遵守交通规则，避免逆行，确保行车安全。