复旦大学作为中国顶尖的综合性大学，学科门类齐全，涵盖了文、理、医、工等多个领域。其学院设置包括以下主要学院：

人文学院

社会科学学院

自然科学学院

技术科学学院

医学院

管理学院

外国语言文学学院

哲学学院

新闻学院

法学院

经济学院

国际关系与公共事务学院

社会发展与公共政策学院

数学科学学院

物理学系

化学系

高分子科学系

环境科学与工程系

大气与海洋科学系

信息科学与工程学院

计算机科学技术学院

软件学院

微电子学院

航空航天系

材料科学系

生命科学学院

大数据学院

基础医学院

临床医学院

公共卫生学院

药学院

护理学院

艺术教育中心

体育教学部

继续教育学院

国际文化交流学院

泛海国际金融学院

马克思主义学院

科技考古研究院

六次产业研究院

全球公共政策研究院

社会科学高等研究院

文史研究院

现代语言学研究院

一带一路及全球治理研究院

中国历史地理研究所

中国研究院

大气科学研究院

大数据试验场研究院

这些学院涵盖了从文学、历史、哲学、社会科学、自然科学、工程技术到医学、管理学、金融、法律等多个领域，为学生提供了广泛的学习和研究机会。