中国人民解放军第二炮兵总医院下属的研究所主要包括以下机构：

烧伤整形科

作为第二炮兵烧伤研究治疗中心，承担大面积烧伤的临床诊治和科研工作，是北京市四家治疗大面积烧伤定点医院之一。

放射医学科

专注于放射损伤的诊断与治疗，属于第二炮兵军事医学研究所的重要分支。

推进剂医学科

主要研究火箭推进剂相关医学问题，服务于军事装备与人员健康保障。

第二炮兵军事医学研究所

下设推进剂医学科、放射医学科和中心实验室，涵盖中毒急救、放射损伤、肿瘤、血液疾病等领域的研究与临床应用。

说明 ：

以上信息综合自医院简介及军事医学研究所的职能描述，未涉及其他可能的研究机构。- 若需了解更详细的信息，建议直接联系第二炮兵总医院或相关研究所。