制药工程专业的考研初试科目通常包括以下几门：

思想政治理论 ：这是所有考研学生必考的科目，主要考察学生的政治素质和思想道德水平。

英语二 ：英语是制药工程考研的必考科目之一，专硕通常考英语（二），学硕则考英语（一）。

数学二 ：数学也是制药工程考研的必考科目，通常使用数学（二）作为考试科目。

专业课 ：不同院校间专业课考查科目有所差异，有些院校考化工原理，有些院校考生物化学或者制药工艺学等。

建议考生在准备考研时，仔细查阅报考院校的具体招生简章和考试大纲，了解专业课的考查内容和要求，以便有针对性地进行复习。