实习司机在实习期内被扣分的规则如下：

扣满12分 ：实习期内累计扣满12分的，实习资格将被注销，需要重新参加科目一考试以恢复驾驶资格。

扣6分以上但不足12分 ：

C1驾驶证：实习期不会延长。

A类、B类驾驶证：实习期延长一年。如果在延长的实习期内再次扣6分以上但不足12分，将注销实习资格。

扣1-11分 ：先去交纳罚款，到下一个记分周期后驾驶证自动恢复到12分。

C类驾照 ：实习期内最多可以扣11分，如果扣满12分则直接注销驾照。

A类、B类驾照 ：实习期内扣不超过6分，否则实习期延长一年，若在延长的实习期内再次扣6分以上但不足12分，将注销实习资格。

综合以上信息，实习司机在实习期内的扣分上限为12分，不同类型的驾驶证在达到不同的扣分阈值后会有不同的处理方式，如实习期延长或注销实习资格等。因此，实习司机应严格遵守交通规则，避免违章行为，以免影响驾驶资格。