徐祖耀教授的学生中，有若干人成为了杰出的科学家，其中包括：

赵连城教授 ，中国工程院院士。

谢锡善 ，北京钢铁学院56届学生，给徐祖耀带来了合影作为惊喜。

柯伟 ，中国科学院的院士。

周邦新 ，中国科学院的院士。

陈国良 ，中国科学院的院士。

徐祖耀教授不仅在学术上对学生进行指导，还在生活中尽力帮助学生解决困难，并在2011年设立了“徐祖耀基金”，主要用于资助优秀青年教师开展科研以及家庭经济困难的学生。