科级干部在五年内的培训总天数应不少于 5天 。

具体规定如下：

汇川区新任科级干部培训 ：为期5天，内容包括理论讲授、专题研讨、视频教学、现场教学、座谈会等，旨在全面提升政治素养、工作能力和领导水平。

乡科级领导干部培训 ：每年参加干部教育培训主管部门认可的集中培训，累计不少于12天或90学时。

因此，科级干部在五年内的培训总天数应不少于5天。