小规模纳税人开具增值税专用发票后，需要按照以下步骤进行缴税：

计算销售额 ：

小规模纳税人需要先计算本期的销售额，包括销售货物和提供劳务所得等。

减去免税销售额 ：

如果小规模纳税人销售的商品或提供的服务中有免税项目，需要将免税销售额从销售额中减去。

计算应纳税额 ：

根据销售额和税率计算应纳税额。目前，小规模纳税人开具增值税专用发票的税率是1%或3%。

税额计算公式为：应纳税额 = 不含税销售额 × 征收率 = 含税销售额 ÷ （1 + 征收率） × 征收率。

填写并提交纳税申报表 ：

小规模纳税人需要填写并提交当期的增值税纳税申报表，表格中需要填写应纳税额、已缴税额等相关信息。

缴纳税款 ：

小规模纳税人需要在规定期限内将应纳税额缴纳至税务机关指定的银行账户中。可以选择网上缴税或到税务局现场缴税。

达到纳税起点 ：

小规模纳税人需要根据国家税法规定，达到规定的纳税起点，才有需缴纳增值税的义务。

税收优惠

小规模纳税人月销售额不超过15万元，季度销售额不超过45万元的免征增值税，但开具增值税专用发票的，无论是否超限额，均须按专用发票上的应纳税额计算缴纳。

如果小规模纳税人开具的专票销售额超过30万元，需要按照3%的税率全额缴纳增值税，并且还需要缴纳企业所得税和附加税（城建税、教育费附加和地方教育附加等）。

注意事项

开具专票时，无论金额大小，均按1%的税率交税。

小规模纳税人应当自行申报纳税，并在年度终了后一个月内向主管税务机关办理纳税申报并缴纳税款。

综上所述，小规模纳税人开具增值税专用发票后，需要按照规定进行增值税的申报和缴纳，并注意相关税收优惠政策的适用。