药学考研最好的学校主要包括以下几个：

北京协和医学院 ：位于北京市，学科评估为A+，强势学科为药学。

北京大学 ：位于北京市，学科评估为A，软科排名为1，强势学科为药学。

中国药科大学 ：位于江苏省南京市，学科评估为A+，软科排名为2，强势学科为药学、药理学与毒理学。

沈阳药科大学 ：位于辽宁省沈阳市，学科评估为A，软科排名为13，强势学科为药学、药剂学、药理学与毒理学。

复旦大学 ：位于上海，学科评估为A-，软科排名为3，强势学科为药理学、药学与毒理学。

浙江大学 ：位于浙江省，学科评估为A，软科排名为5，强势学科为药物分析学、药理学与毒理学。

四川大学 ：位于四川省成都市，学科评估为A-，软科排名为4，强势学科为药剂学、药物化学、药理和毒理学。

上海交通大学 ：位于上海，学科评估为A-，软科排名为6，强势学科为药学、药理学和毒理学。

山东大学 ：位于山东省济南市，学科评估为A-，软科排名为7，强势学科为药学、药物化学、药剂学、微生物与生化药学。

中山大学 ：位于广东省广州市，学科评估为A-，软科排名为10，强势学科为制药科学、药学、药理学。

这些学校不仅在药学学科评估中表现优异，而且在师资力量、科研经费、就业福利和地理位置等方面也具有显著优势。建议根据个人兴趣、专业背景和职业规划，选择最适合自己的学校进行报考。