选择三本土木工程专业考研学校时，可以从以下几个方面进行综合考虑：

学校实力和声誉 ：

大连理工大学 ：作为中央直管、教育部直属的副部级全国重点大学，大连理工大学的土木工程专业实力强，材料力学等考题相对简单，性价比较高。

河海大学 ：河海大学对三本学生没有歧视，土木工程专业实力强，就业前景好，有不少三本学生凭借实力考上。

东南大学 ：东南大学土木工程专业知名度高，虽然近年来排名有所下降，但其土木实力依然强劲，在考研中可以增加录取机会。

天津大学 ：作为中国工程院和教育部共建的全国重点大学，天津大学在土木工程领域具有较高的声誉和实力。

同济大学 ：同济大学在土木工程领域实力雄厚，是值得考虑的学校之一。

清华大学 ：清华大学是土木工程领域最具声誉和影响力的学府之一，但考研难度较大。

地域因素 ：

考虑学校所在地区的经济发展水平和行业需求，选择地域优势明显的学校。例如，大连理工大学位于滨城大连，环境优美，且土木工程相关产业发达。

专业实力 ：

考虑土木工程专业的排名，选择专业实力较强的学校。例如，河海大学、东南大学、天津大学等在土木工程领域均有较强的实力。

个人兴趣和职业规划 ：

根据自己的兴趣和未来的职业规划，选择适合的专业和学校。例如，如果对某一地区的发展前景感兴趣，可以选择该地区的知名学校。

学校层次 ：

优先选择211或985高校，这些学校通常具有较高的教育质量和研究水平。

考研难度 ：

了解学校往年的招生简章中的参考书目，评估自己的复习难度。例如，大连理工大学的考研英语难度较大，需要提前准备。

综合以上因素，以下是一些建议：

大连理工大学 ：适合对土木工程有浓厚兴趣且希望留在大连发展的学生。

河海大学 ：适合对土木工程有较高要求且希望获得优质教育资源的学生。

东南大学 ：适合希望进入顶尖大学且具备较强实力的学生。

天津大学 ：适合希望在北方地区发展且对土木工程有较高要求的考生。

同济大学 ：适合希望在东部沿海地区发展且对土木工程有较高要求的考生。

清华大学 ：适合对土木工程有极高要求且具备极强实力的学生。

最终选择应根据个人实际情况和目标进行权衡，确保选择最适合自己的学校。