制药工程考研的科目主要包括以下几门：

思想政治理论 （满分为100分）。

考研英语二 （满分为100分）。

考研数学二 （满分为150分）。

专业课 ，通常包括以下几门之一：

化工原理

生物化学

制药工艺学

药剂学

药物分析

药物化学

药理学

天然药化

生药学

药事管理

此外，部分学校可能还会要求复试科目，如制药工程学、化工原理综合等。

建议考生在准备考研时，仔细查阅目标院校的招生简章和专业目录，了解具体考试科目和要求，以便有针对性地进行复习。