东南大学设有多个学院，涵盖广泛的学科领域。以下是东南大学的部分学院列表：

建筑学院

机械工程学院

能源与环境学院

信息科学与工程学院

土木工程学院

电子科学与工程学院

数学学院

自动化学院

计算机科学与工程学院

物理学院

生物科学与医学工程学院

材料科学与工程学院

人文学院

经济管理学院

法学院

外国语学院

马克思主义学院

艺术学院

公共卫生学院

医学院

软件学院

集成电路学院

网络空间安全学院

人工智能学院

生命科学与技术学院

国家卓越工程师学院

未来技术学院

海外教育学院

微电子学院

雷恩研究生学院

蒙纳士大学苏州联合研究生院

这些学院为学生提供了丰富的学习与研究机会，涵盖了从哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学、艺术学等多个学科领域。