发酵工程考研主要考察以下几个方面的内容：

微生物学基础 ：包括微生物分类、生理生化特性、生长繁殖规律等。

发酵工艺学 ：涉及发酵过程的基本原理、工艺流程设计、发酵条件控制等。

生物化学与分子生物学 ：包括酶学、代谢途径、基因表达调控等内容。

生物反应器与过程控制 ：研究生物反应器的设计、操作和优化，以及过程监测和控制技术。

下游加工技术 ：涉及产物分离、纯化、检测和质量控制等。

环境微生物学与工业生态学 ：研究微生物在环境保护中的应用，以及工业生产中的生态平衡问题。

生物信息学与系统生物学 ：利用计算机技术和数学模型分析生物数据，理解生物系统的复杂性。

其他科目 ：如生物化学、生物物理化学、生物工程基础、统计学、食品工程、制药工程、化学工程基础、数学方法等。

此外，考研通常还会涉及以下科目：

政治 ：全国统考科目，代码为101。

英语 ：全国统考科目，通常学硕考英语（一），专硕考英语（二），代码分别为201和204。

数学 ：全国统考科目，工学门类中对数学要求较高的专业考数学（一），对数学要求低的专业考数学（二），代码分别为301和302。

具体考试科目和考试内容，建议参考目标院校的官方招生信息或咨询相关学院以获得最准确的信息。