北理工足球队的奖金情况如下：

2006年乙级联赛冠军及冲甲成功 ：

奖金总额为40万元。

2008年赴韩国冬训前 ：

赞助商华旗爱国者公司提供的50万元奖金。

2009年冲甲成功 ：

奖金情况未详细提及，但提到主力球员一年最多能拿到不到3万元的助学金和奖学金。

2013年冲超传闻 ：

校领导半开玩笑地表示，如果冲超成功，奖励球队八百万，但并未实际发放。

综合以上信息，北理工足球队在不同年份的奖金情况有所不同。2006年乙级联赛冠军及冲甲成功的奖金为40万元，2008年赞助商提供的奖金为50万元，2009年冲甲成功的奖金情况不详，而2013年冲超传闻中的奖金则未实际发放。