单位培训费的扣除方式通常有以下几种：

直接扣除：

直接从员工工资中扣除培训费用。

分期扣除：

将培训费用分若干期从员工工资中扣除。

按比例扣除：

根据员工工资的一定比例扣除培训费用，如10%、20%等。

贷款支付：

员工通过贷款支付培训费用，培训结束后再分期偿还。

奖金抵扣：

将员工的奖金部分用于抵扣培训费用。

专项基金支付：

企业设立专项基金，用于支付员工的培训费用。

增值税抵扣：

外出参加培训的住宿费和培训费可以作为进项税额进行抵扣。

职工教育经费：

企业为员工提供的培训费用，在满足一定条件下，可以作为进项税额进行抵扣。

此外，根据相关税收政策，职工培训费用还可以列入企业的成本支出，在计算企业所得税时可以予以扣除。具体扣除标准为：单位每年扣除职工教育经费支出总额不超过该单位上年度工资、薪金总额的2.5%。需要注意的是，职工培训费用的税前扣除需要符合一定的条件和规定，如培训费用必须是实际发生的、与生产经营活动相关的、合理的支出，且需要提供合法有效的凭证和资料等。企业还需要在年度汇算清缴前将符合规定的培训费用从应付职工薪酬中一次性扣除，或选择不超过5年的期限内分摊扣除。