当毕业院校发生更名时，填写毕业院校名称应遵循以下规则：

填写更名后的正式名称 ：如果学校名称已经正式更改，您应该填写更名后的正式名称。这是为了保持信息的一致性和准确性。

参考毕业证书 ：对于往届生来说，毕业证书上标注的学校名称是最准确的来源，因此应以此为准。

使用“其他”选项 ：如果毕业院校名称在提供的选项中没有出现，或者名称与实际就读的学校不符，您可以选择“其他”选项，并在输入框中填写实际的毕业院校名称。

注意名称的准确性 ：无论在哪种情况下，确保填写的学校名称准确无误，避免造成信息的混淆和误解。

备注信息 ：如果需要，可以在新名字后面备注一下老名字，以便不熟悉新名字的人通过备注了解原学校名称。

综上所述，您应该根据您的具体情况选择正确的名称进行填写，并在必要时提供备注信息。