发酵工程 主要属于生物工程学科，是生物工程的一个重要分支 。它利用现代工程技术手段和微生物的特定功能，将微生物应用于工业制造，以解决实际生活中的问题。发酵工程的研究内容涵盖了菌种选育、灭菌、发酵过程等多个方面，并在制药、食品、环境保护等领域有着广泛的应用。

具体来说，发酵工程可以进一步细分为生物工程专业和轻工技术与工程专业下的二级学科。发酵工程是一门建立在细胞纯培养技术基础上，通过操纵遗传物质、调控细胞代谢关键酶和利用现代生物化工大分子分离纯化技术及其相应的现代装备，实现细胞的大规模培养以便获得各种生理活性物质的一门前沿生物高技术学科。

因此，发酵工程既属于生物工程学科，也可以属于轻工技术与工程学科，具体归属可能因学校和学科设置的不同而有所差异。