南京中医药大学第二临床医学院的专业设置涵盖了多个领域，以下是一些主要的专业：

针灸推拿学 ：这是南京中医药大学第二临床医学院的重要专业之一，专注于针灸和推拿技术的教学和研究。

康复治疗学 ：该专业培养康复治疗方面的专业人才，包括物理治疗、作业治疗等。

营养学 ：营养学专业致力于培养营养学方面的专业人才，研究营养与健康的关系。

美容医学 ：该专业涉及美容医学的教学和研究，包括美容皮肤科学、美容外科学等。

养生康复学 ：该专业结合中医养生理论和现代康复技术，培养养生康复方面的专业人才。

这些专业旨在培养具有扎实理论基础和临床实践能力的医学人才，满足社会对中医和康复治疗等领域的需求。