南通地区招收研究生的主要院校是 南通大学 。南通大学（Nantong University），简称“通大”，位于江苏省南通市，是江苏省人民政府和交通运输部共建的综合性大学，属于江苏高水平大学建设高峰计划B类高校。它也是国家“卓越医生教育培养计划”和“卓越教师培养计划”试点高校，以及教育部本科教学工作水平评估优秀学校。

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