408计算机专业基础综合 与 自命题 哪个更难，可以从以下几个方面进行比较：

考试内容 ：

408 ：包括数据结构、计算机组成原理、操作系统、计算机网络四个科目，内容广泛且深入。

自命题 ：通常只涉及统考中的2~3个科目，且难度相对较小。

备考资料与真题透明度 ：

408 ：复习资料、真题、经验非常透明，信息差小，公平性高。

自命题 ：资料获取困难，真题和答案不易获得，增加了备考难度。

风险系数与调剂 ：

408 ：教育部推荐使用统考试卷，风险较低，且调剂时选择权更多。

自命题 ：竞争压力大，风险较高，且调剂难度大，很多自命题院校在调剂时只接受408考生。

信息获取 ：

408 ：信息透明，容易获取考研经验、考情分析、历年真题解析等相关资料。

自命题 ：信息不透明，需要花费大量时间找资料或咨询学长学姐。

综合以上几点，可以得出结论： 408计算机专业基础综合 相对较难，主要体现在考试内容广泛、备考资料不透明、风险系数高以及调剂难度大等方面。而自命题虽然难度可能稍小一些，但备考过程的不确定性和信息获取的困难也增加了其难度。

因此，建议考生在选择考研科目时，充分考虑自身情况和目标院校的出题风格，选择更有把握的统考科目，以提高备考效率和上岸概率。