东南大学有多个校区，其中研究生主要就读于 四牌楼校区和九龙湖校区 。

四牌楼校区 ：位于南京市玄武区四牌楼2号，主要涉及研究生教育、本科生高年级教育、继续教育（除医学学科外）和科学技术研究基地。

九龙湖校区 ：位于南京市江宁区，大部分本科生和研究生在此就读，包括机械工程学院、数学系、物理系、材料科学与工程学院、人文学院、法学院、艺术学院、外国语学院、化学化工学院、计算机科学与工程学院、情报科学技术研究所、经济管理学院等。

建议根据具体学院和专业选择相应的校区，例如，数学系、物理系、材料科学与工程学院、机械工程学院、计算机科学与工程学院、化学化工学院、经济管理学院等大部分研究生专业在九龙湖校区，而其他如医学院、公共卫生学院、生命科学研究院等则在丁家桥校区。