申请商标的费用应当计入 无形资产 科目中。具体来说，可以在“无形资产”科目下开立一个“商标使用权”或者“商标注册费”等子科目，将相关的费用计入其中。在会计报表中，这些费用应该按照其使用寿命进行摊销，并在资产负债表中反映出来。

如果商标费用是用于开发新产品或服务的，则应当计入“研究与开发费用”账户中；如果商标费用是用于购买或注册商标，则应当计入“无形资产”账户中。

对于商标申请成功的费用，可以计入管理费用中的注册费用科目。

如果商标申请费用比较少，则可以直接计入当期的管理费用会计科目中。

商标注册费用应计入企业的无形资产，商标作为无形资产会随时间而消耗，摊销期通常为10年，商标摊销的金额应当计入当期损益。

综上所述，申请商标的费用主要计入“无形资产”科目，并根据具体情况可能涉及“研究与开发费用”、“管理费用”等科目。在会计处理时，这些费用应按照其使用寿命进行摊销，并在财务报表中反映出来。