南京理工大学设有21个专业学院，开设招生专业65个，学科专业分布于理学、工学、文学、经济学、管理学、法学和艺术学等7个学科门类。以下是部分学院及其本科专业（类）的简要介绍：

机械工程学院：机械工程、车辆工程、工业工程、武器系统与工程、弹药工程与爆炸技术、飞行器设计与工程、测控技术与仪器、机器人工程。

环境与生物工程学院：环境工程、生物工程、辐射防护与核安全。

化学与化工学院：特种能源技术与工程、安全工程、应用化学、制药工程、材料化学、高分子材料与工程、化学工程与工艺。

电子工程与光电技术学院：通信工程、电子信息工程、光电信息科学与工程、电子科学与技术、探测制导与控制技术。

计算机科学与工程学院（人工智能学院、软件学院）：计算机科学与技术、软件工程、网络空间安全、智能科学与技术。

经济管理学院：金融学、国际经济与贸易、工商管理、会计学、人力资源管理、大数据管理与应用。

能源与动力工程学院：建筑环境与能源应用工程、能源与动力工程、武器发射工程。

设计艺术与传媒学院：工业设计、环境设计、视觉传达设计、工业设计(中英合作办学项目)。

自动化学院：轨道交通信号与控制、自动化、电气工程及其自动化、智能电网信息工程。

物理学院：光电信息科学与工程（理）、应用物理学、工程力学。

数学与统计学院：数学与应用数学、信息与计算科学、应用统计学。

微电子学院（集成电路学院）：微电子科学与工程。

网络空间安全学院：数据科学与大数据技术、网络空间安全、信息管理与信息系统。

智能制造学院：智能制造工程。

新能源学院：新能源科学与工程。

外国语学院：英语、日语、语言学。

公共事务学院：社会工作、公共事业管理。

马克思主义学院：马克思主义理论。

材料科学与工程学院/格莱特研究院：材料科学与工程、材料成型及控制工程、材料物理、纳米材料与技术。

钱学森学院：电子信息、机械工程、材料化工。

知识产权学院：法学本科、知识产权第二学位、知识产权双学位、知识产权创新实验班。

中法工程师学院：机械工程（中外合作办学）、材料科学与工程（中外合作办学）。

南京理工大学还设有继续教育学院、国际教育学院、国家卓越工程师学院和新生学院等。具体的专业设置和详细信息可以参考学校官网或相关招生资料。