南通科技职业学院设有多个二级学院，涵盖了广泛的学科领域。以下是部分专业列表：

环境与生物工程学院

环境工程技术

环境监测技术

环境管理与评价

药品生物技术

食品智能加工技术

食品检验检测技术

农产品加工与质量检测

智能水务管理

机电与交通工程学院

机械制造及自动化

机电一体化技术

电气自动化技术

汽车制造与试验技术

新能源汽车技术

电梯工程技术

工商管理学院

大数据与会计

电子商务

酒店管理与数字化运营

旅游管理

网络营销与直播电商

现代物流管理

空中乘务

园艺与景观工程学院

园艺技术

园林工程技术

风景园林设计

工程造价

植物保护与检疫技术

信息与智能工程学院

计算机应用技术

计算机网络技术

软件技术

云计算技术应用

工业互联网技术

人文科学系

文秘

商务英语

航空服务

以上是部分专业，具体专业设置和招生计划可参考学校官网或江苏省教育考试院公布的信息。