根据搜索结果，畜牧系考研院校的选择需结合综合实力、专业排名及录取难度等因素。以下是综合推荐及分析：

一、综合实力顶尖院校

中国农业大学

作为农业领域的顶尖学府，中国农业大学在畜牧专业方面长期处于国内领先地位，拥有国家级重点学科和多个国家级科研平台，考研难度较高，但学术资源丰富，适合追求学术深度的学生。

华中农业大学

华中农业大学是211/985工程高校，畜牧专业实力强劲，考研竞争压力适中，且复试分数线相对较低，录取名额较多，适合基础扎实的考生。

二、其他高排名院校

浙江大学 ：农业与畜牧业交叉学科优势明显，考研难度较大，但科研经费充足，适合有科研兴趣的学生。

南京农业大学 ：兽医专业实力突出，录取门槛较高，适合目标明确为兽医领域的考生。

西南大学 ：农业资源丰富，畜牧专业在西南地区具有较高知名度。

三、录取难度参考

华中农业大学 ：近3年复试线平均分约280-290分（不同专业有差异），录取比例适中。

中国农业大学 ：部分热门专业复试线可达300分以上，竞争激烈。

华南农业大学 ：动物遗传育种与繁殖专业复试线约265-291分，录取人数稳定。

四、选择建议

根据目标专业选择 ：

畜牧学：优先考虑中国农业大学、华中农业大学；

兽医专业：侧重南京农业大学、西南大学。2. 结合自身实力 ：

重点院校竞争大，需评估备考能力；

一般院校录取门槛较低，可结合分数与兴趣综合选择。

关注招生动态 ：

不同院校专业方向差异较大，需查阅最新招生简章。

综上， 华中农业大学 和 中国农业大学 是畜牧系考研的首选， 浙江大学 和 华南农业大学 也具备较强竞争力。考生可根据自身分数、职业规划及专业偏好进行选择。