目前明确设有南音专业的大学是泉州师范学院。泉州师范学院的音乐与舞蹈学院（泉州南音学院）自2003年起设立了南音专业，专门培养既有音乐理论基础又懂得泉州南音演唱演奏的人才。

还有其他学校和机构与南音有关联，但并未明确设立南音专业，例如晋江市慎中实验学校、第二外国语学校、德化县老年大学、泉州老年大学和南安市闽风南韵文化传承中心等，这些学校和机构通过不同的活动和课程，推广和传承南音这一古老乐种。

目前明确设有南音专业的大学是泉州师范学院。