生物医学工程考研可以选择以下几所大学：

清华大学

浙江大学

华中科技大学

北京航空航天大学

东南大学

天津大学

四川大学

哈尔滨工业大学

复旦大学

中国科学技术大学

华南理工大学

西安交通大学

北京大学

上海交通大学

中山大学

武汉大学

中国药科大学

暨南大学

吉林大学

沈阳医科大学

山西医科大学

广州医科大学

华中农业大学

西北农林科技大学

南京师范大学

中国海洋大学

中南大学

云南大学

陕西师范大学

兰州大学

第四军医大学

北京林业大学

内蒙古大学

中国医科大学

大连医科大学

东北林业大学

哈尔滨医科大学

安徽农业大学

福建农林大学

河南大学

河南师范大学

华中师范大学

湖北大学

湖南农业大学

湖南师范大学

西南大学

这些学校在生物医学工程领域都拥有较强的学科实力和优秀的师资力量，并且拥有丰富的科研成果和教学经验。建议根据个人兴趣、专业背景和目标院校的具体要求，综合考虑选择适合自己的学校。