中山大学南校区设有多个学院，开设了许多专业。以下是一些主要的专业：

人文科学学院：

中国语言文学系：汉语言文学、汉语国际教育

历史学系：历史学、考古学

哲学系：哲学、逻辑学

理学与基础学科：

生命科学学院：生物科学、生态学（生态学为A+学科，全国第1）

数学学院：数学与应用数学、统计学（珠海校区重点发展计算数学与数据科学）

物理与天文学院：物理学、天文学（拥有“天琴计划”引力波探测国家重大科技基础设施）

医学与生命科学：

中山医学院（临床医学、基础医学）

工学与新兴技术：

电子与信息工程学院：电子信息类、集成电路设计与集成系统（对接国家“芯片自主化”战略）

计算机学院：计算机科学与技术、网络空间安全（参与“天河二号”超算项目）

经管与商科：

岭南学院：经济学、金融学（应用经济学学科评估B+，与牛津大学、麻省理工开设双学位项目）

管理学院：工商管理、会计学（工商管理学科评估A+，与哈佛商学院合作案例教学）

其他特色学院与交叉学科：

外国语学院：外国语言文学类（英语、德语、法语、日语等）

社会学与人类学学院：社会学、人类学、考古学

这些专业涵盖了文、理、医、工、管等多个领域，体现了中山大学的综合性研究型大学的特色。