企业缴纳印花税的方法如下：

确定纳税期限 ：印花税按季、按年或者按次计征，企业需要根据自身情况选择合适的纳税期限。

计算应纳税额 ：企业需要根据应税凭证的性质，按照对应的税率或者征收率计算应纳税额。例如，购销合同、加工承揽合同等都需要缴纳印花税，税率一般为合同金额的万分之三。

填写申报表 ：企业需要登录电子税务局，填写《印花税纳税申报表》，并核对无误后提交。

选择合适的缴纳方式 ：企业可以根据自身实际情况和应税凭证的类型选择合适的缴纳方式，包括贴花纳税、大额税额开票征收、频繁业务汇总申报以及难以计算时的依法核定。

缴纳税款 ：企业需要按照申报表上的金额，通过银行转账等方式缴纳税款。

利用优惠政策 ：企业应了解和利用印花税的优惠政策，减轻税负。例如，某些特定行业或区域可能有税收减免政策。

委托代征 ：企业也可以委托相关部门代征印花税，一般委托发放或者办理应税凭证的单位。

其他注意事项 ：企业需要准确识别哪些合同和凭证需要缴纳印花税，避免漏缴或误缴。同时，在合同签订或相关经济活动发生后，应及时进行印花税的申报和缴纳。

通过以上步骤，企业可以顺利完成印花税的缴纳工作。建议在实际操作中，企业应保持与税务机关的沟通，及时了解最新的税收政策，确保合规缴税。