如果你在毕业前签订了三方就业协议，后来决定考研，你需要遵循以下步骤进行操作：

与原单位协商 ：

向原签约单位提出书面申请，请求解除就业协议，并请求单位出具书面同意的解约函（需加盖公章）。

提交材料 ：

将原单位的解约函、研究生录取通知书复印件、个人申请报告（附上学院意见）等材料提交给学校毕业生就业工作部门。

等待审批 ：

学校毕业生就业工作部门会根据相关规定审批，并可能换发新的《就业协议书》。

档案处理 ：

你的个人档案在毕业前由学校保管，毕业后根据三方协议的规定，档案可能会被发送到您的工作单位或指定的人才交流中心。

户口和档案转移 ：

如果你决定不继续在原单位工作，户口和档案可以根据学校的规定和流程进行转移。

违约责任 ：

如果你在签约前未与原单位明确约定违约金数额，或者你的违约行为符合法律或协议规定的解除条件，你可能不需要支付违约金。

其他注意事项 ：

确认学校对于解约的具体政策和程序，确保所有行动符合政策和程序。

如果遇到不友好的单位，可以考虑在毕业答辩和毕业设计等方面寻求学校的帮助。

如果学校非要求签订协议不可，可以在学校所在地找一个小公司应付，但需事先与公司沟通好。

请确保在处理这些事务时，保持与学校、单位和相关部门的良好沟通，并妥善保存所有相关的文件和证据。