土木工程博士阶段的学习书籍主要包括以下几类：

基础理论课程教材 ：

《高等数学》

《线性代数》

《理论力学》

《材料力学》

《结构力学》

专业知识教材 ：

《土力学》

《混凝土结构设计》

《地震工程学》

《水力学》

《建筑结构抗震》

《土木工程材料》

《建筑制图》

《土木工程施工》

专业方向书籍 （根据培养方向选择）：

结构工程方向：

《钢结构设计手册》

《朱炳寅的四大名著》（包括抗震规范、混凝土规范等）

安全工程方向：

相关安全工程教材和资料

实践技能与科研能力相关书籍 ：

《现代土木工程》

《土木工程概论CAI》

《土木工程概论》

《怎样当一名研究生》

《工程力学中的近似解方法》

《大学慎思教育笃行》

其他推荐书籍 ：

《铝结构原理与设计》

《土建工程基础》

《建筑工程管理专业》

《计算思维与大学计算机基础》

《大学计算机基础（Windows10+Office 2016）》

《土木工程制图与CAD/BIM技术》

《建筑制图与CAD习题集》

这些书籍涵盖了土木工程专业的基础理论、专业知识、实践技能以及科研能力等多个方面，有助于博士生全面深入地掌握土木工程的知识和技能。建议根据具体的研究方向和兴趣选择相应的书籍进行学习。