王雷在控制方面存在的问题主要包括以下几点：

缺乏事中控制 ：王雷只进行了简单的事前和事后控制，没有实施事中控制。控制过程应该结合事前控制和事中控制，以确保各项活动按计划进行。

控制标准不灵活 ：控制标准必须实事求是、科学可行。标准既不能设置得太低，以免缺乏激励作用；也不能设置得过高过严，避免员工产生抵触或对立情绪，导致控制失效。

控制目的不明确 ：王雷的控制主要问题在于没有明确控制的目的，即保证组织中的各项活动按计划进行，并通过监督和纠偏来实现这一目的。

控制过程不系统 ：王雷只是在年初简单地定下了指标，并没有将指标分解，形成一个目标体系，进行跟踪和监督，找出问题所在并进行事中监督和控制。

控制手段过于单一 ：王雷的控制手段较为单一，没有根据具体情况采取多样化的控制策略，例如事中监控、适时调整控制标准，以及加强与员工的沟通和协作。

综上所述，王雷在控制方面存在的问题主要是缺乏事中控制、控制标准不灵活、控制目的不明确、控制过程不系统以及控制手段过于单一。为了改进控制效果，王雷可以考虑实施更加细致和灵活的控制策略，包括事中监控、适时调整控制标准，以及加强与员工的沟通和协作。