复旦大学和清华大学都是中国顶尖的高等学府，在多个学科领域具有显著的优势。选择哪个学校更好考研，需要根据个人的专业兴趣、学术目标和实际情况来综合考虑。

学科实力 ：

清华大学 ：在工学、理学、经济学、管理学等学科方面处于绝对领先地位，拥有极高的学术声誉和社会影响力。计算机学院、五道口金融学院等学院更是顶尖学子的竞争热点。

复旦大学 ：在文学、理学、经济学、管理学、医学等学科方面实力雄厚，特别是在人文底蕴和金融实力方面具有显著优势。管理学院和泛海国际金融学院等学院生源质量高。

考研难度 ：

清华大学 ：考研难度极高，难度值高达97.73，在全国高校考研难度排名前100中位列第1。

复旦大学 ：考研难度也相当高，位列全国第3，整体较为稳定。

专业选择 ：

清华大学 ：适合对工科、计算机、金融等前沿领域有浓厚兴趣的学生。

复旦大学 ：适合对人文社科、金融、管理等领域有浓厚兴趣的学生。

地理位置 ：

清华大学 ：位于北京，拥有得天独厚的地理位置和丰富的学术资源。

复旦大学 ：位于上海，生活节奏较快，是中国最繁华的都市之一。

建议 ：

如果你对理工科特别是计算机、金融等前沿领域有浓厚兴趣，且希望进入国内顶尖高校深造，清华大学无疑是更好的选择。

如果你对人文社科、金融、管理等领域有浓厚兴趣，复旦大学也是一个非常好的选择，其人文底蕴和金融实力在全国名列前茅。

综合考虑学科实力、考研难度、专业选择和地理位置，清华大学和复旦大学都是考研的热门且优秀的选择，具体哪个更好还需根据个人实际情况和兴趣来决定。