根据多个权威来源的综合评估，本科日语专业最好的大学主要集中在以下几所，具体推荐如下：

一、国内顶尖高校

北京外国语大学

国内一流外国语类院校，日语专业为全国唯一拥有日本语言文学国家重点二级学科（培育）的机构，长期位居教育部学科评估首位。

师资力量雄厚，教学设施完善，注重语言能力与跨文化交际能力培养，设有日语语言文化、翻译等方向。

上海外国语大学

与北京外国语大学齐名，国际化程度高，地处上海国际金融中心，拥有大量日本语母语教师。

专业涵盖语言、文化、翻译等，注重实践创新，毕业生就业竞争力强。

对外经济贸易大学

国家特色专业，日语专业通过教育部审批，以商务日语为特色，培养涉外经济贸易人才。

北京第二外国语学院

专注小语种教学，日语专业历史悠久，师资经验丰富，适合对外交流需求。

二、其他高水平院校

东北师范大学 ：日语专业学术水平较高，注重语言文学与跨文化研究。

天津外国语大学 ：国家重点建设高校，日语专业覆盖语言、文学、翻译等领域。

黑龙江大学 ：俄语与日语专业并重，教学资源丰富。

三、特色院校推荐

大连外国语大学 ：辽宁省重点学科，日语学习环境优越，教师团队实力强。

广东外语外贸大学 ：国家特色专业，注重口语与实践能力培养。

四、选择建议

明确需求 ：

若侧重学术研究，优先考虑北京外国语大学或上海外国语大学；

若以就业为导向，可关注大连外国语大学、对外经济贸易大学等；

对口日语教师招聘可考虑外国语特色学校（如佛山北博德翰外国语学校）。

参考因素 ：

学校排名、学科资质、师资力量、实习机会及就业率等；

结合个人学习风格和职业规划综合选择。

以上推荐综合了多方面信息，具体院校可根据实际情况进一步了解和对比。