民航运输专业考研可以选择以下学校：

中国民航大学 ：

直属于中国民航局，民航院校的排头兵，专业丰富，特别是运行控制、机务维修等专业具有行业优势。与各大航空公司有合作，就业率较高。

南京航空航天大学 ：

211工程名牌院校，专业实力强。在华东地区与各大空管局、管理局、航空公司、机场有密切联系与合作。毕业生去向多为行政单位或国有企业，工作稳定，待遇好。

中国民航飞行学院 ：

直属于中国民航局，培养民航飞行员的摇篮。全国大部分飞行员由该校培养，飞行专业竞争力强。研究生招生工作起步阶段，报名人数不多，录取相对容易。

大连海事大学 ：

交通运输部所属的全国重点大学，是国家“211工程”和“双一流”建设高校。被国际海事组织认定的世界上享有国际盛誉的海事院校之一。

西南交通大学 ：

交通运输工程学科排名靠前，具有广泛的学科门类和丰富的教育资源。

北京航空航天大学 ：

国内知名的航空航天类高校，拥有较为专业的适航领域研究机构和实验室，课程体系和师资力量完善，适合对适航专业感兴趣的研究生。

哈尔滨工业大学（威海） ：

哈尔滨工业大学的分校，也提供民航运输专业的研究生课程。

沈阳航空航天大学 ：

也开设民航硕士专业，有一定的行业认可度和就业前景。

郑州航空工业管理学院 ：

在航空领域有一定的教学和研究实力。

西华大学 ：

在适航专业方面也有一定的研究和教学能力。

长安大学 ：

拥有交通运输工程学科，适合考研。

湖北汽车工业学院 ：

在汽车和交通领域有一定的教学和研究实力。

重庆理工大学 ：

在机械工程和管理工程领域有一定的教学和研究实力。

兰州交通大学 ：

在交通运输工程领域有一定的教学和研究实力。

东北林业大学和黑龙江大学 ：

在林业和水利工程领域有一定的教学和研究实力。

哈尔滨师范大学 ：

在师范教育领域有一定的教学和研究实力。

这些学校都在民航运输专业领域有较强的教学和研究实力，并且与民航行业有密切的联系和合作，提供了丰富的实习和就业机会。建议根据个人兴趣、专业背景和职业规划选择合适的学校进行报考。