作废发票的保存方法包括以下几种：

装订保存 ：

将作废发票的所有联次装订在一起，并在发票上标记作废标志。

按月将作废发票装订成册，以便于管理和核查。

数字化保存 ：

将作废发票扫描或拍照，以数字化形式存储在电脑或其他电子设备中。

在电脑上建立电子档案，记录作废发票的相关信息，方便查阅。

标记处理 ：

在纸质发票上加盖“作废”字样，并确保所有联次都得到妥善保管。

账务处理 ：

虽然作废发票不需要进行账务处理，但财务部门应根据国家准则记录作废发票的摘要信息，以备核实。

保存期限 ：

根据相关法规，发票存根联和相关账册应保存5年，而增值税专用发票等涉税资料应保存10年。

特殊处理 ：

对于因开票错误等原因作废的专用发票，需要全联次留存，以备税务局审计使用。

归档备查 ：

将作废的发票以适当的方式归档，如隔封或折纸，以便日后查验。

定期销毁 ：

企业可以定期对作废发票进行集中销毁，如碎纸机粉碎或专业机构销毁，确保信息无法恢复。

建议 ：

确保遵循当地税务机关的规定和要求 ，因为不同地区可能有细微差别。

建立完善的发票管理制度 ，包括台账记录和定期归档，以便于管理和核查。

对于作废的专用发票 ，要特别注意全联次留存，以满足税务局的审计需求。

通过以上方法，可以有效地保存作废发票，确保其安全性和可追溯性。