北京协和医学院的硕士学费如下：

全日制学术学位硕士研究生 ：学费为8000元/学年。

全日制专业学位硕士研究生 ：学费为12000元/学年。

非全日制硕士研究生 ：学费为15000元/学年。

基础医学、法医学、药学硕士研究生 ：免交学费。

非全日制公共卫生硕士（MPH） ：学费为3万元/学年。

请注意，这些信息可能会根据时间和政策有所变动，建议直接咨询北京协和医学院获取最新信息。