山东省重点学科：应用化学、理论物理

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山东省人才培养模式创新实验区

菏泽学院教师教育专业人才培养创新实验区

山东省实验教学示范中心

机电工程实验教学中心

山东省高水平应用型专业群

机械电子工程专业群、小学教育专业群、化工专业群、生物工程群等

山东省特色专业

生物教育、心理咨询、物理学、财务管理、化学工程与工艺、生物科学

山东省卓越工程师计划专业

机械电子工程、食品科学与工程

山东省专业综合改革试点项目

财务管理

山东省精品课程

文学概论、写作、思想道德修养与法律基础、微生物学、人体组织解剖学、

数字电子技术、排球、电路分析基础、高频电子线路、模拟电子技术、C语言、

软件工程、数据结构、金工实训、电工实训、数控实训、汽车实训、传感器原理

及应用、微机原理与接口技术、DSP原理与应用、数字信号处理、信号与系统

山东省双语教学示范课程

植物生理学