南京3+4本科的学校有：南京航空航天大学、南京大学、南京理工大学、南京农业大学、南京师范大学等。

1、南京航空航天大学

南京航空航天大学，简称南航（NUAA），是中华人民共和国工业和信息化部直属的一所具有航空航天民航特色、以理工类为主的综合性全国重点大学，是国家“世界一流学科建设高校”，国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校，入选国家“111计划”。