南京二手房的首付比例根据购买套数有所不同，具体如下：

购买首套房

如果购买面积不超过90平方米，最低首付比例为20%。

如果购买面积超过90平方米，最低首付比例为30%。

购买二套房

最低首付比例为50%。

根据最新政策，二套房的首付比例已经从之前的70%降低到45%。

购买三套房

最低首付比例为100%。

建议在购买二手房时，向当地银行或相关部门咨询最新的首付比例和贷款政策，以确保符合最新的购房要求。