施工单位确认工程量的方法主要包括以下几点：

依据施工过程中形成的书面文件

施工过程中形成的签证等书面文件是确认工程量的首要依据。这些文件包括会议纪要、工程变更单、工程对账签证等，能够直接反映工程量的变化和实际情况。

提供其他证据

如果缺乏书面文件，施工单位可以提供其他证据来证明实际发生的工程量。这些证据可能包括施工日志、照片、视频、第三方监理单位出具的证明、证人证言等。这些证据需要经过举证、质证等程序，以证明其真实性、合法性和关联性。

按照合同约定的程序进行确认

工程量的确认通常需要遵循合同约定的程序。例如，承包人应按专用条款约定的时间向工程师提交已完工程量的报告，说明本期完成的各项工作内容和工程量。工程师接到报告后，按设计图纸核实已完工程量，并在现场实际计量前通知承包人共同参加。如果承包人收到通知后不参加计量，工程师自行计量的结果有效，作为工程价款支付的依据。

多方审核和确认

工程量的确认需要经过多方审核和确认。确认单经监理单位审核通过后，上报建设甲方代表确认，并依次转至设计单位、第三方造价单位、代建单位（如有）、建设单位审核后签字盖章。涉及到的施工和监理单位人员需附上身份证复印件。

结合图纸设计和实物勘测

工程报量通常根据图纸设计和实物勘测的方式进行。图纸设计报量依据设计图纸标注的尺寸、数量等信息计算工程量；实物勘测则是对现场实际工作进行勘测和测量，确保工程精度和正确性。

预算和进度报告

施工单位需要将所有工程量做成预算，并附上详细的进度报告。按照合同约定的时间，向监理工程师提交已完工程量的报告。这有助于确保工程量的准确性和及时性。

综上所述，施工单位确认工程量的方法包括依据施工过程中形成的书面文件、提供其他证据、按照合同约定的程序进行确认、多方审核和确认、结合图纸设计和实物勘测以及编制预算和进度报告。这些方法有助于确保工程量的准确性和公正性，维护施工单位的合法权益。