单位注册二级建造师证需要遵循以下步骤：

1. 准备所需材料

单位需要准备以下材料：

二级建造师执业资格证书原件

身份证原件及复印件

毕业证书原件及复印件

与聘用单位签订的劳动合同原件及复印件

填写完整的《二级建造师初始注册申请表》

2. 提交注册申请

将上述材料提交至聘用单位所在地的省级建设行政主管部门或其委托的机构。需要注意的是，提交的材料应当是真实有效的，如有虚假，将会受到相应的处罚。

3. 审核

相关部门会对提交的材料进行审核，以确认申请人是否符合注册条件。审核通过后，会进行公示，公示期通常为10天。公示期间无异议的，则进入下一步。

4. 注册

公示无异议的，由建设行政主管部门核发《中华人民共和国二级建造师注册证书》和执业印章。至此，二级建造师的注册手续基本完成。

5. 继续教育

取得《中华人民共和国二级建造师注册证书》后，每三年需要进行一次继续教育，以确认其专业水平及合规性。未参加继续教育的，将无法进行下一期的注册。

6. 注意事项

在注册过程中，需要注意以下几点：

确保所有材料的真实性，不得有伪造或篡改的行为。

遵守相关法律法规，按照规定的程序和时间节点完成注册流程。

妥善保管好《中华人民共和国二级建造师注册证书》和执业印章，不得转借或转让给他人使用。

7. 变更注册信息

若二级建造师的工作单位发生变动，应及时向新的工作单位所在地的省级建设行政主管部门或其委托的机构提出变更注册申请。变更注册时，同样需要提供相关材料，并按照规定程序办理。

8. 注销注册

当二级建造师不再从事相关工作或者达到法定退休年龄时，应向原注册机关提出注销注册的申请。注销注册后，该建造师将不再具备执业资格。

通过以上步骤，单位可以顺利完成二级建造师证的注册工作。在整个过程中，单位应严格遵守相关规定，确保注册工作的顺利进行。