实际施工人在结算工程款时，应遵循以下步骤和原则：

向合同相对方主张权利

实际施工人应首先向合同相对方，即转包人或违法分包人主张权利。这是实际施工人追讨工程款的主要途径，因为合同关系直接决定了双方的权利义务。

遵循法律法规和行业规范

实际施工人在结算过程中需要遵循合同法的相关规定，确保所有结算活动基于合同约定进行。同时，还需考虑劳动法、建筑行业标准和安全规范等，以保障自身权益。

确定结算依据

实际施工人应根据工程量清单等结算依据，详细记录施工过程中完成的各项工作和使用的材料，为结算提供准确依据。

规范结算流程

实际施工人需要按照规定格式提交结算报告，详细说明工程完成情况和费用计算。结算报告需提交给业主或总承包商进行审核，双方确认无误后才能进行最终的款项支付。

考虑诉讼途径

如果与合同相对方协商无果，实际施工人可以向有管辖权的法院提起诉讼。在诉讼中，需提供充分的证据证明自身是实际施工人、工程情况、损失的具体数额及成因等。法院会根据实际情况和相关法律规定进行审理，判定发包人是否应承担赔偿责任以及赔偿的具体数额。

申请财产保全

在提起诉讼的同时，实际施工人可以根据情况申请对发包人财产进行保全，以确保判决后的执行。如发现发包人有转移、隐匿财产等行为，应及时向法院报告。

注意法律时效

实际施工人在追讨工程款时，应注意法律时效，及时采取行动，以免错过诉讼时效。

综上所述，实际施工人在结算工程款时，应首先向合同相对方主张权利，遵循法律法规和行业规范，确定结算依据，规范结算流程，并在必要时考虑通过诉讼途径解决问题。同时，注意法律时效，确保自身权益得到有效保障。