配套施工合同的监管可以通过以下方式进行：

事前审查

行政主管部门应对合同当事人订立的合同进行审查，查看合同的主体、客体和内容是否符合法律规定。这包括对施工单位的资质、施工方案的合理性、可行性等方面进行审查。

事中监督

在合同履行过程中，行政主管部门应对合同当事人的检查督促，包括检查当事人是否有利用合同变更进行不法性活动等。此外，还应关注施工进度、施工质量、安全生产、环境保护等方面，确保施工过程合规。

事后验收

组织相关人员进行施工验收，确保施工质量符合国家标准和设计要求。对于施工过程中出现的问题，应及时提出整改意见，并跟踪整改措施的落实。

加强对承包商的资质管理

通过严把建筑承包商资质管理关，从总量上控制建筑施工队伍的规模，解决目前建筑市场上供求失衡与过度竞争问题，从根本上杜绝恶意竞争、变相压价的不良行为。同时，各级建设行政主管部门要加强对承包商参与市场行为的监督管理，对承包商的违法行为要严肃处理，维护正常的建设市场环境。

合同预备阶段的管理

在施工合同管理的初期阶段，项目方需要进行一系列的合同预备工作，以确保后续的施工过程能够顺利进行。这包括确定合同范围和目标，明确施工工程的具体内容、质量要求、工期要求等，确保项目方和承包方对合同的理解一致，以避免后期的纠纷。

建立完善的合同管理机制

明确各类不同合同管理的任务领域，制定规范合法的合同格式文本，掌握内容的主动权。完善合同的管理机制，严把合同的审核关，重视合同的订立以及对于合同内容执行的监督程序。

通过以上措施，可以有效地监管配套施工合同，确保合同的履行过程合规、质量达标、安全无事故，从而保障整个工程项目的顺利进行和完成。